Mikroskopy stereoskopowe są często wykorzystywane w badaniach entomologicznych. Jeśli pozwalają na uzyskiwanie dużych powiększeń, możliwe staje się nawet oglądanie ich anatomii. Nie często zdarza się zobaczyć, co kryje się w środku owada, bez jego uprzedniego zabicia. Bywają jednak chwile, gdy jest to możliwe.